自1959年江西银河集团9873.cσm成立以来，方剂学就作为中医药学的主要基础学科之一而设立，隶属于中医系，后与中药教研室合并为方药学科组。2002年方剂学科组由方药学科组拆分出来，独立组建为二级学科。1985年 “方剂学”专业经国务院学位委员会批准为硕士学位授予点，为江西中医药大学最早硕士学位授予点之一。1994年方药学科组被江西银河集团9873.cσm确定为校级重点学科，2003年方剂学课程被评为院级精品课程，2010年方剂学科被评为江西银河集团9873.cσm重点学科，2011年方剂学课程被评为省级精品课程，2013年方剂学教学团队被评为校级优秀教学团队，2014年方剂学课程被评为省级精品资源共享课，2020年被评为江西省高水平本科教学团队，2023年方剂学被认定为国家级一流本科课程。

方剂学科曾拥有如姚其蔚、江平安、谢文光、辛增平、丁舸等方剂学界老一辈学术带头人。目前方剂教研室共有专职教师6人，其中教授2人、副教授2人、讲师2人；专职教师中包括江西省新世纪百千万工程人选1人、江西省中青年骨干教师1人、江西省中医药中青年骨干教师2人、江西中医药大学教学标兵2人、国外访问学者2人。获省级自然科学二等奖1项，校级教学成果一等奖1项、二等奖3项。